実験の目次

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このページ

  1. 基礎的な項目
  2. 染色実験
  3. DNA, RNA 実験
  4. タンパク質実験
  5. クロマトグラフィー
  6. 質量分析
  7. 実験の節約術
  8. 実験の記録

移動したセクション

  1. 行動実験
  2. Lab safety
  3. 細胞 の培養
  4. NMR と MRI

複数のセクションに同じ実験へのリンクがある場合には、同じページに飛びます。例えば「エタノール沈殿」は基礎的な実験なので「実験手法の基礎」にありますが、主に DNA, RNA の沈殿に使われるため「DNA, RNA 実験」のセクションからもリンクがあります。

次世代シークエンシングとそのデータ解析法は Bioinrofmatics で解説しています。下記のサイト内検索からどうぞ。


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基礎的な項目

実験の基礎

  1. ガラス体積計の使い方
  2. pH について
  3. 緩衝液 buffer について
  4. 凍結乾燥機の使い方
  5. ピペットのメンテナンス
  6. エタノール沈殿

基礎になる知識



組織染色実験

染色実験の基礎

  1. 染色実験の概要
  2. パラフィン包埋
  3. パラホルムアルデヒドについて

In situ hybridization

  1. In situ ハイブリダイゼーション
  2. FISH (染色体に対する in situ)

抗体を使った染色

  1. 免疫染色

さまざまな染色実験

  1. HE染色
  2. LFB 染色: ミエリン鞘の染色
  3. MT 染色: 結合組織の染色
  4. オイルレッド O: 脂質の染色
  5. PAS 染色: 糖の染色

その他 追加したいもの

  1. グラム染色
  2. Hoechst 染色: 核の染色
  3. Picrosirius 染色: コラーゲンの染色

DNA, RNA実験

DNA 抽出、電気泳動

  1. DNA の抽出
  2. エタノール沈殿
  3. DNA の電気泳動
    • プラスミドの電気泳動
    • DGGE 法
    • SSCP 法
  4. A260/280 比
  5. A260/230 比

PCR 関連

  1. PCR の目次とトラブル 対策
  2. プライマーの設計
  3. PCR 阻害物質

リアルタイム PCR 関連は「RNA の定量実験」に。


クローニングの基礎知識

  1. 大腸菌の遺伝子型一覧
  2. プラスミドの定義と一覧
  3. ベクター関係の用語集

クローニング実験

  1. LB 培地
  2. コンピテントセルの作製
  3. 制限酵素処理
  4. ライゲーション
  5. 大腸菌からのプラスミド抽出
  6. グリセロールストックの作り方
  7. シークエンス

大腸菌発現系

  1. 発現ベクターの構築
  2. 大腸菌での発現

RNA の定量実験

  1. RNA の抽出
  2. RNA の品質評価: RIN 値とは
  3. ノーザンブロット
  4. cDNA 合成
  5. 半定量 RT-PCR
  6. リアルタイム PCR
  7. 内部標準遺伝子について

ゲノム編集技術

  1. CRISPR/Cas9
  2. TALEN
  3. ZFN


タンパク質実験

基礎的な実験

  1. タンパク質の抽出
  2. タンパク質の濃度測定
  3. SDS-PAGE
  4. 等電点電気泳動

抗体を使った実験

  1. ウエスタンブロット
  2. 免疫沈降
  3. ELISA

酵素活性の測定

  1. 酵素とは
  2. プロテアーゼ活性の簡易測定

その他の生体分子に関する実験

脂質の抽出法

  1. Folch 法
  2. ソックスレー (Soxhlet) 法
  3. Bligh & Dyer 法

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クロマトグラフィー: Chromatography

クロマトグラフィーの概要 のページに、用語集など全体的な内容があります。


HPLC

  1. HPLC の概要

ゲル濾過

  1. ゲル濾過とは

TLC

  1. TLC の概要
  2. TLC による乳糖の検出

質量分析

基礎

  1. 質量分析の概要

実験の節約術

充実させたい項目。とりあえず以下のリンクを紹介。

  1. RNAlater とその代用品
  2. BioTechnical フォーラム、節約術
  3. 2ch 赤貧ラボ自慢

実験の記録

適当にやってみた高校 ~ 大学レベルの実験です。

  1. タンパク質抽出: プロテアーゼ阻害剤を入れずに、適当にやってみた実験の記録があります。大量の大腸菌からの抽出なら問題なさそう。
  2. メイラード反応 のページにミルクおよびアミノ酸・糖混合物の加熱実験があります。
  3. のページに、尿素 で卵白の凝固を防止する実験があります。終濃度 4 M なら凝固を防止できます。
  4. TLC による乳糖の検出 のページに、牛乳のラクトースを検出した実験があります。
  5. キウイ のページに、キウイをハムの上にのせるとプロテアーゼ活性で穴が開くということを試した実験があります。ネット情報でしたが失敗に終わりました。