緑色蛍光タンパク質 GFP: 構造、種類、配列など

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このページの最終更新日: 2019/11/08

  1. 概要: GFP とは

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概要: GFP とは

GFP とは、緑色蛍光タンパク質 (green fluorescent protein) の略称である。


GFP の種類

他の色の蛍光タンパク質も含めている。

hrGFP

hrGFP は humanized Renilla green fluorescent protein の略であり、日本語ではヒト化 Renilla 緑色蛍光タンパク質という。Renilla reniformis の本来の配列を改変し、ヒトでよく使われる コドン に置き換えたもの。

EGFP

Enhanced GFP で、37°C でのフォールディング能力が改善され、結果として wtGFP よりも強い蛍光を発する (2)。


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メモ

GFP の配列をググって探そうとしたのだが、意外と見つからない。GenBank でも、ベクターの配列の一部として登録されているものの、GFP 単独の配列は珍しいようだ。そこで、ベクターから GFP 部分だけ配列を切り出してまとめておく。


References

  1. Berg et al. 2006a. (Book). Biochemistry, 6th edition.

Berg, Tymoczko, Stryer の編集による生化学の教科書。 巻末の index 以外で約 1000 ページ。

正統派の教科書という感じで、基礎的な知識がややトップダウン的に網羅されている。その反面、個々の現象や分子に対して生理的な意義があまり述べられておらず、構造に偏っていて化学的要素が強い。この点、イラストレイテッド ハーパー・生化学 30版 の方が生物学寄りな印象がある。

英語圏ならば学部教育向けにはややレベルが高い印象。しかし、基本を外さずに専門分野以外のことを 研究レベルで 英語で読みたいという日本人には非常に適しているだろう。輪読とかにも向いているかもしれない。翻訳版はストライヤー生化学として売られている。


  1. Arpino et al. 2012a. Crystal structure of enhanced green fluorescent protein to 1.35 Å resolution reveals alternative conformations for Glu222. PLoS ONE 7, e47132.
  2. Crossman et al. 2018a. EGFR signaling coordinates patterning with cell survival during Drosophila epidermal development. PLoS Biol 16, e3000027.

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