In-fusion クローニングによるベクター構築:
原理、プロトコール、プライマー設計など

UBC/experiments/dna/vector_in_fusion

このページの最終更新日: 2024/02/14

  1. 概要: in-fusion とは
  2. In-fusion プライマーの設計
  3. その他の ligase を使わないクローニング方法

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概要: in-fusion とは

In fusion とは、

In-fusion プライマーの設計

たとえば、マウス mouseメラノコルチン-3受容体 遺伝子の翻訳領域を、in-fusion を使って pUC19 というベクターに組み込みたいとしよう。PubMed で検索対象を Nucleotide にし、mouse melanocortin で検索すると、melanocortin 3 receptor (Mc3r), mRNA (NM_008561.3) がみつかる。塩基配列は以下の通り。下線部分が翻訳領域である。

ACATCTAGCGTCAAGTCCCACAACCCCTGGCTCGCTAGAAGTAGAGCTGTAACTGTAGCAACGGGTGTCG GGTGGGGATGAGAGAAGACTGGAGAGAGAGGGTCAGAGCTAGAGGGGATGAGGCAGGCTGATCAGACTCT GCACTGATTGCTGGAGACCGCAAAGGAAAGTTCTTTCTATGTCTCCAAGCCCCACTCCCTCTCTATCTAT CTATCTATCTATCTATCTATCTATCTCTCCCTCTCTGGAGAAACTAAAGTCTAGACTGGACAGCATCCAC AAGAGAAGCACCTAGAAGGAGAATTTTCCCCAGCAGCTTGCTCAGGACCCTGCAGGAGCCGCAGCTGGGA CTGGACCTGCTGTTAACCATGAACTCTTCCTGCTGCCTGTCTTCTGTTTCTCCGATGCTGCCTAACCTCT CTGAGCACCCTGCAGCCCCTCCTGCCAGCAACCGGAGCGGCAGTGGGTTCTGTGAGCAGGTCTTCATCAA GCCGGAGGTCTTCCTGGCTCTGGGCATCGTCAGTCTGATGGAAAACATCCTGGTGATCCTGGCTGTGGTC AGGAATGGCAACCTGCACTCTCCCATGTACTTCTTCCTGTGCAGCCTGGCTGCAGCCGACATGCTGGTGA GCCTGTCCAACTCCCTGGAGACCATCATGATCGCCGTGATCAACAGCGACTCCCTGACCTTGGAGGACCA GTTTATCCAGCACATGGATAATATCTTCGACTCTATGATTTGCATCTCCCTGGTGGCCTCCATCTGCAAC CTCCTGGCCATTGCCATCGACAGGTACGTCACCATCTTCTATGCCCTTCGGTACCACAGCATCATGACAG TGAGGAAAGCCCTCACCTTGATCGGGGTCATCTGGGTCTGCTGCGGCATCTGCGGCGTGATGTTCATCAT CTACTCCGAGAGCAAGATGGTCATCGTGTGTCTCATCACCATGTTCTTCGCCATGGTGCTCCTCATGGGC ACCCTATATATCCACATGTTCCTCTTCGCCAGGCTCCACGTCCAGCGCATCGCAGTGCTGCCCCCTGCTG GCGTGGTGGCCCCACAGCAGCACTCCTGCATGAAGGGGGCTGTCACCATCACTATCCTGCTGGGTGTTTT CATCTTCTGCTGGGCGCCTTTCTTCCTCCACCTGGTCCTCATCATCACCTGCCCCACCAATCCCTACTGC ATCTGCTACACGGCCCATTTCAACACCTACCTGGTTCTCATCATGTGCAACTCCGTCATCGACCCCCTCA TCTACGCCTTCCGCAGCCTGGAGCTGCGCAACACGTTCAAGGAGATTCTCTGCGGCTGCAACAGCATGAA CTTGGGCTAGGATGCCCGTGGAGGTGTTCCACATCCAGC (後略)


1.

まず、タカラバイオのページ にある Design your primers から、デザインツールを launch する。


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References

  1. Snap Gene pUC 19 vector. Link.

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