1. 基礎的な項目
2. 分類群による目次
3. 編集メモ・ファイル命名法

基礎的な項目

1. 生命の定義
2. 進化について: 概要、定義など
3. 生命の起源
4. 生物の分類法
   • 種の定義
   • PubMed Taxonomy による分類
5. 動物の体の構造: 相称、内胚葉、体腔など、主に門レベルの分類と関係する構造

分類群による目次

生物の分類法のページにあるように、生物は原則として

というメインの階層で分類されている。

たとえば、実験動物としてよく使われる「マウス」は、和名を「ハツカネズミ」といい、以下のように分類される。

このページは、例外的に「その他」の項目も設けているが、原則として 綱レベルよりも上の分類群 のページの目次である。「マウス」のページに行くには、脊索動物門や哺乳綱のページを経由する必要がある。

これが面倒な場合は、サイト内検索をご利用ください。生物名で検索して頂ければ、すぐに目的にページにたどり着けます。

ドメインレベルの分類

1. 真核生物: Eukaryota
2. 古細菌: Archaea
3. 真正細菌: Bacteria
   
   
4. ウイルス

古細菌、真正細菌を合わせて 原核生物 prokaryotes という。

現在の定義では、ウイルスは生物ではないとされており、これらのドメインには含まれない。しかし、ウイルスも同じような体系で分類されているため、ウイルスのページもここからリンクしておく。

界 kingdom レベルの分類

1. 原生生物: Protists
2. 植物: Plants
3. 菌類: Fungi
4. 動物: Animal

門 phylum レベルの分類

動物

• カイメン動物門: Porifera
• 線形動物門: Nematoda
• 節足動物門: Arthropoda
• 脊索動物門: Chordata

綱 class レベルの分類

1. 哺乳綱: Mammalia
2. 魚類
   • 条鰭綱 Actinopterygii
3. 鳥綱 Aves
4. 爬虫綱 Reptilia
5. モクレン綱 (双子葉植物綱)
   • 芝属
   • トウガラシ属

属 genus レベルの分類

1. マイコプラズマ
2. レーシュマニア

その他

1. Rosids 非公式分類、バラ類。ヤセイカンラン
2. Euglenozoa no rank, ミドリムシ

編集メモ・ファイル命名法

このサイトでは、原則として綱 classの名前でフォルダを作り、属 order および種名で html ファイル名を作っている。たとえばマウス Mus musculus の場合、そのページの URL は

https://ultrabem.com/organism/Mammalia/mus_musculus.html

となる。

綱が存在しない場合は、目 order よりも上の分類群でフォルダを作っている。「綱」よりも大きい分類群について概要をまとめるときは taxa フォルダに html ファイルを作る。原核生物、原生生物、植物のページなどが該当する。

References

1. Amazon link: Berg et al. 2006a. (Book). Biochemistry, 6th edition.

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