1. 分類の基礎
2. 学名について

分類の基礎

生物は、まず大きく 3 つのグループに分けることができる (1)。

1. 真核生物: Eukatyotes, Eukarya
2. 細菌: Bacteria
3. 古細菌: Archaea

これらは ドメイン domain と呼ばれる分類群で、最も高い階層の分類である。Archaea は比較的最近認められるようになった分類群なので、用語に多少の混乱がある。原核生物 prokaryote という言葉は、かつて Bacteria とほぼ同義であったが、現在では Bacteria および Archaea の両方を意味する。

Domain を含め、それ以降の階層を表にした。ただしこれはかなり単純化した分類であり、実際には亜綱、上目などのさらに細分化されていて、それらが教科書によって異なっている (頻繁に更新される) のが現状である。

このような場合には、複数の情報源をランダムに参照するのではなく、誰もが参照できる権威のあるデータベースに基づいて考えることが重要になる。このサイトでは、このページで解説したように PubMed Taxonomy による分類 を基本としたい。

上記の分類には語呂合わせがあり、買い物 (かいもん) の項目を忘れて、家族にしゅかられた (しかられた) と覚える (参考: 生物学の語呂合わせ集)。

このサイトでは、原則として「綱」の名前でフォルダを作り、属および種名で html ファイル名を作っている。たとえばマウス Mus musculus の場合、そのページの URL は

https://ultrabem.com/organism/Mammalia/mus_musculus.html

となる。綱が存在しない場合は、目 order よりも上の分類群でフォルダを作っている。ときには subphylum であり、Euglenozoa のように no rank の分類群になることもある。

「綱」よりも大きい分類群について概要をまとめるときは、taxa というフォルダにファイルを作っている。現在のところ原核生物、原生生物、植物 などのページがこれに相当する。

学名について

学名 scientific name とは、属名と種名から成る (2)。たとえば Homo sapiens など。表記には以下のようなルールがある。

1. 属名、種名の順に示す。
2. 属名の最初の文字は大文字、それ以外は小文字。
3. イタリックで表記する。イタリックが使えない場合はアンダーラインでも可。

学名は生物種 species と 1 : 1 に対応する。たとえば「カメレオン」と言った場合、これは正確にはカメレオン科 family Chamaeleonidae の約 200 種を含む分類群である。しかし Anolis carolinensis のように学名で書けば、これはただ一つの種を示すことになり、曖昧さを回避できる。

ただし、実際には亜種があったり系統があったりと、生物の分類はさらに複雑になってきている。

References

1. Amazon link: ストライヤー生化学: 使っているのは英語の 6 版ですが、日本語の 7 版を紹介しています。参考書のページ にレビューがあります。
2. Amazon link: Audesirk et al. 2013a. Biology: Life on Earth with Physiology, eBook, Global Edition (English Edition): 新しいバージョンへのリンクです
3. Amazon link: Hine (2015). Oxford Dictionary of Biology.
4. 平山 2016a (Review). ヒトの腸内菌の分類に関する総論. 腸内細菌学雑誌 30, 5-15.

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