プラスミド精製キット: 原理、各社製品の比較など

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このページの最終更新日: 2020/06/11

  1. 原理
  2. スピンカラムについて
  3. 各社製品の比較

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原理

プラスミド精製キットの多くは、アルカリ法 で抽出したプラスミドをカラムで精製するという方法をとっている。

とりあえず各社のキットの値段をまとめた。なお、キットを買わずに別売りのカラムと自作バッファーでプラスミド精製することも可能だが、コストはほぼ同じ (マンパワー分マイナス) という検討結果がある (1)。この 研究費が無い というページには面白い記事が多いので、一読をお勧めする。

原理はあとで追加する。とくにスピンカラムの正体、古くなったカラムは使えるのか、DNA 精製キットのカラムと使い回しできるのかなど。ネット上に情報がほとんどないので、必要なら実験してみて追加したい。


スピンカラムについて

とりあえず原理の画像 (2)。シリカでできており、DNA と Na+ を介して静電的相互作用をしているようだ。



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各社製品の比較

値段は各社のホームページに載っていたものなので、実際の価格とは異なる場合がある。キット名のあとの ( ) の中はカタログ番号。

価格の $673/100 preps は、100 個入りのキットが売られているという意味。$1 未満は切り捨て。大きいキットの方が単価は安いが、よく使うと思われる 50 - 100 preps のもので比較している。 ( ) はその価格から計算したサンプルあたりの値段。2018 - 2019 年ごろの情報。


Qiagen
Plasmid mini kit (12125)

$673/100 preps
($6.7/sample)

カラム精製キットでは定評のある Qiagen だが、この値段はちょっと問題だろう。

NEB
Monarch plasmid miniprep kit (T1010S)

$82/50 preps
($1.6/sample)

BioRad
Quantum prep (7326100)

$200/100 preps
($2.0/sample)

Thermofisher
GeneJET plasmid miniprep kit (K0502)

$70/50 preps
($1.4/sample)

Thermofisher
PureLink Quick plasmid miniprep kit (K210010)

$78/50 preps
($1.56/sample)

細かく読んでないが、GeneJET より収量、純度が少し高いようだ。

Zymo Research
Zyppy plasmid miniprep kit (D4036)

$65/50 preps
($1.3/sample)

集菌しなくてもプラスミド抽出できるタイプ。

Zymo Research
ZymoPURE plasmid miniprep kit

$83/50 preps
($1.3/sample)

Zyppy が 25 µg までの plasmid を抽出できるのに対し、こちらは 100 µg まで。

Sigma-Aldrich
GenElute plasmid miniprep kit (PLN-70)

$111/70 preps
($1.58/sample)

10 preps の小さいキットもある。

カラムを使う前に、Column preparation solution を入れて遠心する必要があるので、一手間多い。

溶出は 100 µL だが、高濃度プラスミドが必要な場合は 50 µL。Elution buffer を温めるオプションがないか?


ひと昔前と比べて選択肢が多い印象。同じ会社からでも、微妙に違う複数のキットが出ている。全く網羅できてないが、現時点での最安値は Zymo Research。

私の場合、当面は plasmid をシークエンスして大腸菌に入れるだけなので、あまり収量、純度にこだわる必要がない。単に値段で決めて実験を始めてみる。


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アップデート前、このページには以下のようなコメントを頂いていました。ありがとうございました。

2017/10/10 11:36 ザイモ使ってます。安いけど問題ないですよ。



References

  1. 研究費が無い. ミニプレップを自作Buffer+単品カラム購入で頑張ってみる. Link: Last access 2019/07/16.
  2. By Squidonius (talk) - Own work (Original text: self-made), Public Domain, Link