転写の概要: 開始,伸長,終了

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10-3-2017 updated

  1. バクテリアの転写
  2. 真核生物の転写

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バクテリアの転写

バクテリアの転写は,以下の 3 つの段階に分けることができる (1)。

Initiation

Initiation は,さらに以下の 4 つの段階から成る (1)。

  1. プロモーターが認識される。
  2. Transcription bubble が形成される。
  3. rNTP の間に最初の結合が作られる。
  4. 転写装置がプロモーターから離れる。

コアプロモーター のページで示したように,バクテリアの転写には -10 に TATAAT という consensus 配列をもつ Pribnow box があり,-35 には -35 region と呼ばれる TTGACA という配列が存在する。これらが転写に必須のコアプロモーターである (1)。


Elongation

Initiation の最後の段階で,RNA polymerase は構造変化を起こし,プロモーター中の consensus sequence に結合していられなくなる (1)。ここから下流に transcription apparatus が移動していく段階を elongation という。

DNA の 2 本鎖が順次解かれ,RNA が合成される。37 °C のバクテリアでは,1 秒あたり約 40 塩基 の RNA が作られる。DNA の複製は 1000 - 2000 nt/s の速度で進むので,転写の速度は DNA 複製よりもはるかに遅い (1)。


Termination

Termination には 2 つのパターンがある (1)。

Rho-dependent termination の場合は,Rho というタンパク質が RNA 中の rut (rho utilization site) を認識する。

Rho-independent termination の場合は,RNA 自体がヘアピン構造を作り,転写を終結させる。


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References

  1. Amazon link: Pierce 2016. Genetics: A Conceptual Approach: 使っているのは 5 版ですが,6 版を紹介しています。