生物多様性について:
定義、階層、調べ方など

UBC/environment/ecology/biodiversity

このページの最終更新日: 2021/07/08

  1. 生物多様性について
  2. 遺伝的多様性について
  3. 種多様性について
    • α, β および γ 多様性
  4. 生態系多様性について

広告

概要: 生物多様性について

生物多様性に関する概念は、以下のように階層化されている (チャート式シリーズ 新生物 生物基礎・生物, Amazon link)。


  • 生物多様性 biodiversity
    • 遺伝的多様性 genetic diversity
    • 種多様性 species diversity
      • 種の多様さ (豊富さ) species richness
      • 種の均等度 species evenness
    • 生態系多様性 ecosystem diversity

遺伝的多様性 は、種内の多様性を表す概念である。たとえば犬は一つの種だが、大きい犬、小さい犬などの多様性がある。

種多様性 には、種の豊富さ species richness と均等度 species evenness の 2 つの種類がある。詳細は 種の豊富さと Rarefaction curve のページにまとめた。

生態系多様性 は、生物だけでなく生息環境の多様性をも含む概念である。つまり、森林、川など様々な生息環境があること、種間関係が多様であること、物質循環が多様であることなどがここに含まれる。

遺伝的多様性について

追加予定。


広告

種多様性について

上述のように、種多様性は種の豊富さ species richness と均等度 species evenness によって決まる概念である。このほかに、どのサンプルを用いて多様性を論じるかによって、α、β、γ 多様性という概念がある (1) 。

α 多様性

1 つのサンプルにおける多様性 を表す指標であり、値が大きいほど種の多様性が高い。以下のように多数の指標があり、種の豊富さを重視するもの、均等度を重視するものなど様々である。

  • Chao1: 種の豊富さを重視、とくに希少種に重みをつけた指標 (1)。
  • Shannon index: 最もよく使われている指標 で、サンプル全体に対する種の割合に基づく (1)。
  • Pielou's eveness index: 均等度を重視する指標。
  • Simpson index: これもよく使われる。

β 多様性

α 多様性はサンプル固有の値を与える指標であるが、β 多様性は 2 サンプル間での多様性の差 を示す指標である。したがって「・・距離」という名前の指標が多い。

  • Jaccard 距離
  • Bray-Curtis 距離
  • Unifrac 距離 – weighted と unweighted がある。

γ 多様性

生態系多様性について

追加予定。


広告

References

  1. α 多様性と β 多様性.Link: Last access 2020/10/22.
  2. Qiime2 を用いた 16S rRNA 菌叢解析.Link: Last access 2020/10/22.

コメント欄

各ページのコメント欄を復活させました。スパム対策のため、以下の禁止ワードが含まれるコメントは表示されないように設定しています。レイアウトなどは引き続き改善していきます。「管理人への質問」「フォーラム」へのバナーも引き続きご利用下さい。

禁止ワード: http, the, м (ロシア語のフォントです)


このページにコメント

Name:


Comment:



これまでに投稿されたコメント

Date Name Comment