1. 概要: ヒトのマイクロバイオーム
2. ヒト皮膚のマイクロバイオーム
3. ヒト腸内のマイクロバイオーム

概要: ヒトのマイクロバイオーム

ドメイン bacteria および archaea にはそれぞれ 30 および 5 の門が含まれる (3; ただし、この数は文献によって違うと考えられる)。このうち、ヒトの腸内から検出されるのはそれぞれ 11 および 1 門である。

さらに、bacteria においては Firmicutes, Bacteroidetes, Actinobacteria, Proteobacteria の 4 門が菌叢のほとんどを占める (3)。

マイクロバイオーム解析から導かれるデータの一つが、マイクロバイオームの 生物多様性 である。アルファ多様性、ベータ多様性、種の豊富さ など複数の指標がある。

ヒト皮膚のマイクロバイオーム

> ヒト皮膚のマイクロバイオームも、よく研究されている分野である。

• 方法論に関する Review。
• Ma et al. Sensitive な頭皮の人とそうでない人を n = 30 ぐらいで集めて、皮膚の性状、皮脂、細菌叢などを比較。細菌叢は次世代シーケンスで調べている。
• Young vs. Old Western European Women で、皮膚の細菌叢を比較した論文。Rouaud-Tinguely et al., 2018.

ヒト腸内のマイクロバイオーム

> 腸内細菌のメタボロミクスに関するレビュー (1)。

• ヒトの体には、神経細胞と血液細胞を除いて 10¹² の細胞がある。
• 皮膚にも 10¹² 程度の細菌がおり，口内には 10¹⁰、腸内には 10¹⁴ の細菌がいる。細菌の種数は 1000 以上 (2)。
• 腸内細菌がいない マウス は、腸の発生が阻害される。ゼブラフィッシュでも同様のデータがある。
• 薬品は，腸内細菌の作用によって毒物になることもある。実例もいくつか引用されている。
• 世界中のラボのラットの microbiota の網羅的解析プロジェクトがあった。

有害な腸内細菌に対しては抗生物質を使うのが一般的であるが、ロシアなど抗生物質が入手しにくい時期があった国では、バクテリオファージを使ったファージセラピーが発展している。

References

1. Nicholson et al. 2005a (Review). Gut microorganisms, mammalian metabolism and personalized health care. Nat Rev Microbiol 3, 431-438.
2. Pareek et al. 2019a. Comparison of Japanese and Indian intestinal microbiota shows diet-dependent interaction between bacteria and fungi. NPJ Biofilms Microbiomes 5, 37.
3. 平山 2016a (Review). ヒトの腸内菌の分類に関する総論. 腸内細菌学雑誌 30, 5-15.

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