原子量、分子量、式量、質量などの意味と違い

other_topics/biochem_basic/molecular_weight
6-14-2017 updated

  1. 定義
  2. 電気泳動図での示し方


広告

定義

原子量 atomic weight

原子量 atomic weight (相対原子質量 relative atomic mass とも言う) は、ある基準に基づいて定められる原子の質量である (2)。

現在の基準では、天然の同位体比をもつ元素の平均原子質量と、12C の原子質量の 1/12 の比として定義される 単位のない無次元の量である。この「天然の同位体比をもつ」というのが複雑なところで、天然では約 1 % の割合で 13C が、さらに少ない割合で 14C が存在しているため、炭素の原子量はちょうど 12 にはならず、12.01 となる。


分子量 molecular weight

ある化学物質の分子量 molecular weight は、その分子を構成する原子の原子量の和 であり、やはり無単位である (1,2)。

タンパク質電気泳動 (SDS-PAGE) の図でよく出てくる kDa は、以下に示す「質量」の単位なので、分子量と混同しないこと。Molecular weight という用語が混乱の一因になっている。Relative molecular mass という別名も覚えておいた方が良いだろう (1)。


式量 formular weight

式量 formula weight は、分子量と同様に化学式の中に含まれている原子の原子量の総和であるが、その構成単位が分子として明確に決められない場合に用いる言葉 である。

たとえば KCl は、便宜的に 1 分子のように書き表しているが、結晶状態では K と Cl が格子状に結合しており、KCl という単位での区切りは存在しない。水溶液では K+ と Cl- に電離しており、これも KCl という単位ではない。このような場合に式量という言葉を用いる。

イオンではイオン式量、高分子では高分子式量を用いるなど、包括的な物質量を示す用語である。

同じ考え方で、タンパク質の複合体も「構成単位が分子として明確に決められない」構造である (1)。このため「ピルビン酸デヒドロゲナーゼ複合体の分子量」などという表現も正しくなく、質量を用いるべきである。


質量

単位をもたない原子量、また原子量の和として定義されているために同様に無単位の分子量および式量に対して、質量 mass は 単位をもつ量 である。よく分子量の単位として誤使用される Da は 1924 年に提案され、2006 年に国際単位系国際文書第 8 版によって正式に認定された (1)。静止して基底状態にある自由な炭素原子 12C の 1/12 に等しい質量 として定義されており、これは 1.660538921 (73) x 10-27 kg に等しいようである。(73) は不確かさを示す。


広告

電気泳動図での示し方

以上の定義から、文献 1 の筆者が指摘しているように 分子量 molecular weight の単位として kDa を使うのは誤りである ということになる。最もよく使われるのは、下のような ウエスタンブロット の図だろう。

Lee et al. 2008

この図 (3) のように、kDa と書くときは Molecular weight と書いてはいけないということ。また、キロは本来小文字で表記するのが正しいようだが、これはまあ良いのではないかという気がする。

ただし、最近はメンブレン全体を載せている図は皆無に等しく、ほとんどが下の図 (4) のように分子量 (質量) すら載せていない。タンパク質名を示しているだけである。この風潮についても、市販の抗体がどの程度信頼できるかという観点から、いずれ考察してみたい。

Kang et al. 2013
広告

コメント欄

コメントをどうぞ! (500 字まで)


フォーラムを作ったので、各ページにあるコメント欄のうち、コメントがついていないものは順次消していきます。今後はフォーラムをご利用下さい。管理人に直接質問したい場合は、下のバナーからブログへ移動してコメントをお願いします。


References

  1. 吉野 2013a (Review). 意外に知らない分子量と質量の単位の違い. 生物工学 91, 464-468.
  2. 岩波 理化学辞典 第4版: リンクはアマゾンの最新版に飛びます。
  3. Lee et al. 2008a. The Caenorhabditis elegans AMP-activated protein kinase AAK-2 is phosphorylated by LKB1 and is required for resistance to oxidative stress and for normal motility and foraging behavior. J Biol Chem 283, 14988-14933.
  4. Kang et al. 2013a. Dimethylfumarate suppresses adipogenic differentiation in 3T3-L1 preadipocytes through inhibition of STAT3 activity. PLoS ONE 8, e61411. Link